.Skripsi:
- Fundamentalisme Agama: Studi Pemikiran Abdurrahman Wahid dan TH Sumartana, UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta, 2006
Buku
- Kontributor, Runtuhnya Negara Tuhan; Membongkar Otoritarianisme Dalam Wacana Politik Islam” (INSIDE, 2005)
- Kontributor, Kebebasan dalam Perbincangan Filsafat, Pendidikan dan Agama” (Pilar Media, 2006)
Jurnal dan Majalah
- “Agama di Tangan Para Fundamentalis; Memahami Kembali Fundamentalisme Agama” Jurnal Perta Departemen Agama RI Edisi Vol VII, No 02, 2005
- “Mengakhiri Pertengkaran Sains dan Agama”, Jurnal Justisia, Fakultas Syariah, IAIN Walisongo Semarang, April 2005
- “Postmodernisme dan Makna Agama”, Jurnal Religiosa, No II Tahun 2006
- “Menimbang Kembali Eksklusifitas Beragama; Upaya Membentuk Komunitas Agama Yang Progresif-Transformatif”, Jurnal Universalia, Vol I No I, Desember 2005.
- “Dialog Agama Untuk Kemanusiaan” Majalah HumaniusH Edisi I/Oktober 2005
- “Zakat Fitrah dan Keberpihakan kepada Mustadh’afiyn”, Journal CRSe, Oktober 2004
- Menjalin Persatuan Di Tengah Pluralitas Agama, Majalah BAKTI, No 148 Thn XIII Oktober 2003
- Pelpres 36 Dalam Kacamata Agama (Al-Fikr Probolinggo, lupa edisinya)
- Dan Lain Sebagainya
Media Massa
- Jihad Melawan Kuffar (Duta Masyarakat, 05-07-2002)
- Agama Masa Depan : Ikhtiar Dialog Agama-Agama (Duta Masyarakat, 31-05-2002)
- Ketika Hidup Tanpa Tuhan (Duta Masyarakat, 30-07-2002)
- Qou Vadis Demokrasi Di Indonesia (Duta Masyarakat, 08-08-2002)
- Konstruksi Agama Humanis-Progresif (Duta Masyarakat, 13-08-2002)
- Sebuah Pencarian Konsep Relasi Agama Dan Negara (Duta Masyarakat, 21-08-2002)
- Membumikan Inklusivisme Agama (Duta Masyarakat, 21-08-2002)
- Ikhtiar Dialog Agama-Agama (Duta Masyarakat, 18-09-2002)
- Di Butuhkan Ulama Perempuan (Duta Masyarakat, 01-10-2002)
- Dari Inklusivisme Agama Menuju Globalisasi Agama (Duta Masyarakat, 09-10-2002)
- Mistifika (Duta Masyarakat, 17-02-2003)
- Kosmosentrisme Agama (Duta Masyarakat, 18-12-2003)
- Sejarah Perlawanan Rakyat Terulang (Duta Masyarakat, 15-01-2003)
- Harga Naik, Mega Turun (Duta Masyarakat, 22-01-2003)
- Islam Agama Rahmat (Duta Masyarakat, 24-01-2003)
- Potret Kaum Muda NU I, (Duta Masyarakat, 30-01-2003)
- Potret Kaum Muda NU II (Duta Masyarakat, 31-01-2003)
- Haji Dan Kesalehan Sosial (Duta Masyarakat, 06-02-2003)
- Kurban Dan Solidaritas Sosial (Duta Masyarakat, 11-02-2003)
- Membangun Pendidikan Pluralis (Duta Masyarakat, 19-02-2003)
- Perempuan, Air Bersih Dan Kematian Bayi, (Duta Masyarakat, 9-01-2003)
- Tantangan Masa Depan IPNU, (Duta Masyarakat, 25-02-2003)
- Ketidakdewasaan Politik Indonesia, (Duta Masyarakat, 11-03-2003)
- Meneguhkan Gagasan Islam Pluralis (Duta Masyarakat, 13-06-2003)
- Gus Dur, PKB dan Pemilu 2004 (Duta Masyarakat, 20-06-2003)
- Perempuan dan Upaya Kesetaraan Gender Duta Masyarakat, 26-06-2003)
- PTN sebagai Lahan Bisnis Duta Masyarakat, 02-07-2003)
- Mungkinkah Islah Politik Matori-Alwi ? (Duta Masyarakat, 09-07-2003)
- Agama dan Revolusi Sosial-teologis Duta Masyarakat, 29-07-2003)
- Islam Sebagai Komuditas Politik Duta Masyarakat, 02-08-2003)
- Cak Nur, Gus Dur & Pendidikan Politik (Duta Masyarakat, 14-09-2003)
- Revitalisasi Peran dan Fungsi Pesantren (Duta Masyarakat, 06-09-2003)
- Hibridisasi Pemikiran NU Duta Masyarakat, 30-09-2003)
- AIDS Bukan sekedar Basa-basi Duta Masyarakat, 12-12-2003)
- Renegosiasi Politik dan Gerakan Mahasiswa pada Pemilu 2004 (Duta Masyarakat, 02-12-2003)
- Hidden Agenda Bantuan AS ke Pesantren (Duta Masyarakat, 05-11-2003)
- Hindari Logika Politik Destruktif (Duta Masyarakat, 12-02-2004)
- Konversi Standar Keadilan (Duta Masyarakat, 29-06-2004)
- Pendidikan Sebagai Retorika Capres (Duta Masyarakat, 24-06-2004)
- Mengarifi Kehadiran Militer (Duta Masyarakat, 02-07-2004)
- Pesantren di Tengah Arus Globalisasi (Duta Masyarakat, 19-07-2004)
- Hari Raya Kurban dan Korban Tsunami (Duta Masyarakat, 20-01-2005)
- Radikalisme Agama dan Tatanan Dunia Baru (Duta Masyarakat, 21-12-2003
- Langkah Strategis Buat PMII (Duta Masyarakat, 18-05-2005)
- Coblos Partai dan Nama Caleg (Duta Masyarakat, 03-02-3004)
- Menimbang Lokalitas Islam (Media Indonesia, 28-03-2003)
- Agama Edisi Revisi (Media Indonesia, 11-04-2003)
- Autentisitas Dan Lokalitas Islam (Media Indonesia, 23-05-2003)
- Mengkaji Teologi Transformatif (Media Indonesia, 27-06-2003)
- Memaknai Kembali “Islam Kita” (Media Indonesia, 01-08-2003)
- Islam Sebagai Sebuah Nama (Media Indonesia, 10-10-2003)
- Membangun Agama Kerakyatan (Media Indonesia, 05-12-2003)
- Menyempurnakan Agama Kerakyatan (Media Indonesia, 26-12-2003)
- NU dan Kebingungan Identitas (Media Indonesia, 29-11-2004)
- Bukanlah Akhir dari Terorisme (Media Indonesia, 18 -06-2007)
- Siapakah Guru Bangsa Kita ? (Jawa Pos, 13-05-2004)
- Keluar dari Karnaval Ramadhan (Jawa Pos, 23-10-2004)
- Mendidik Tidak Cukup di Meja (Jawa Pos, 19-03-2004)
- Moral Force dengan Telepon Genggam (Jawa Pos, 27-12-2004)
- Anak Muda Bukan Segalanya (Jawa Pos, 15-05-2004)
- Agama Dalan Cetakan Baru (Jawa Pos, 07-12-2003)
- Mempertimbangkan Gagasan Eco-Theology (Jawa Pos, 30-01-2005)
- Haji Dan Kesalehan Sosial (Solo Pos, 07-02-2003)
- Tangungjawab Sosial Pascaibadah Haji (Solo Pos, 21-02-2003)
- Mengharap Pemikiran Baru Dari NU (Solo Pos, 09-10-2003)
- Merancang Agama Masa Depan (Solo Pos, 27-02-2004)
- Pornografi Dalam Pandangan Islam (Solo Pos, 16-07-2004)
- Isra’ Mi’raj dan Transformasi Sosial (Solo Pos)
- Peran Agama Pada Saat dan Pasca perang (Solo Pos, 25-02-2003)
- Mereformasi Sistem Pendidikan (Suara Karya, 29-07-2003)
- Soekarno Tetaplah Soekarno (Suara Karya, 21-08-2003)
- Mahasiswa Sambut Pemilu 2004 (Suara Karya, 31-03-2004)
- 100 Hari Pemerintah SBY (Suara Karya, 29-11-2004)
- Zakat Fitrah dan Keberpihakan kepada Mustadh’afyin (Suara Karya, 22-11-2004)
- Kampanye di Kampus, Ironikah ? (Bernas, 08-07-2003)
- Politik Dosen, Impian Rakyat (Bernas, 11-12-2003)
- PKB, Kiai dan Tanggungjawab Sosial (Bernas, 03-12-2003)
- Silaturrahmi (Bernas, 26-12-2003)
- Aktivis Jadi Caleg Golkar (Bernas, 15-01-2004)
- Kapitalisasi Agama (Bulletin Ikhtilaf, 14 -10- 2005)
- Merebut Kebenaran Agama (Bulletin Ikhtilaf, 17 -06- 2005
- Beragama Dengan Santun (Bulletin Ikhtilaf, 08 -07- 2005)
- Melindungi Kaum Buruh (Bulletin Ikhtilaf, 11-06-2004)
- Muhammad dan Pembebasan Perempuan (Bulletin Ikhtilaf, 15-04-2005)
- Menyoal Peran Agama (Pontianak Post, 18-04-2003)
- Menyikapi Hal yang Dianggap Benar (Suara Merdeka, 16-07-2004)
- Perselingkuhan Agama dan negara (Kaltim Post, 11-10-2004)
- Agama Dalam Tafsir Negara (Batam Pos, 11-12-2004)
- Beragama Dengan Nurani (Batam Pos, 22-10-2004)
- Fiqh al-Bi’ah; Fiqh Ramah Lingkungan (Bulletin An-Nadar, P3M, 18-03-2005)
- Saatnya Kita Isra’ Mi’raj (Bulletin An-Nadar, P3M, 11 -09-2004)
- Cetak Biru Fiqh Politik Perempuan (Surabaya Post, 21-06-2004)
- Isro Mi’roj dan semangat emansipasi sosial (Surabaya Post, 1-10-2005)
- Meneladai Hijrah Nabi (Bulletin Al-Rasikh UII, 11-02-2005)
- Meneladai Hijrah Nabi, (Bulletin Al-Rasikh UII, 11-02-2005)
- Cetak Biru Agama ‘Aqly (Bulletin Kinasih UIN Sunan Kalijaga June 2004)
- Dari Konflik ke Dialog Peradaban (Sinar Harapan, 26-05-2005)
- Agama dan Tanggungjawab Lingkungan (Bulletin Khazanah, 18-03-2005)
- Menyusun Teologi Perlawanan (PPMI DK Yogyakarta)
- Dan Lain Sebagainya
Resensi Buku
- Kiai Sebagai Makelar Politik (Tabloid Warta, Maret 2003)
- Kiai Sebagai Aktor Politik (Surabaya News, 09-03-2003)
- Membangun Fiqih Agama-Agama (Suara Pembaruan, 18-01-2004)
- Geneology of Political Crises in Early Islam (Jakarta Post, t24-04-2005)
- Scholar Explores Muslim Clerics’ ‘appreciation’ of Women (Jakarta Post, 13-03-2005)
- Resensi : Historiografi Islam (Duta Masyarakat, 25-01-2003)
Daftar tulisan-tulisan artikel ini sampai pada pertengahan 2006. Untuk tulisan-tulisan setelah itu, akan di update di kemudian hari.





